22115 ToloScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit (with gDNA Eraser)
产品概述
产品简介
ToloScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit (with gDNA Eraser) 是含有基因组 DNA 去除步骤的 cDNA一链合成专用试剂盒,可使用 Total RNA 或 Poly A+ RNA 为模板合成第一链 cDNA,适合下游 qPCR 定量反应和长片段 cDNA 扩增。试剂盒中的 5 × gDNA Erase-Out Mix 可在 42℃,2 min 条件下快速去除基因组DNA 污染,保证实验数据真实可靠并可简化 qPCR 引物设计,无需跨外显子设计引物。 本产品提前预混了RTase、RNase inhibitor、dNTP Mix 等,使用时只需要根据下游实验添加适当的逆转录引物。
产品组成
| 组分 | 22115-01 (50 rxns) | 22115-02 (100 rxns) |
5 × gDNA Erase-Out Mix |
100 μL | 200 μL |
4 × ToloScript RT EasyMix a |
250 μL | 500 μL |
4 × NO RT Control EasyMix |
25 μL | 50 μL |
Oligo (dT)20VN |
50 μL | 100 μL |
Random hexamers |
50 μL | 100 μL |
Nuclease-free water |
1 mL | 1 mL |
a. 含RNase inhibitor、 dNTP Mix 等
保存条件
-20℃储存,≤ 0℃运输。
实验流程
体系后续反应为 PCR
1. RNA 模板变性
| 组分 | 体积 |
| Total RNA | 10 pg - 5 μg |
| or Poly A+ RNA | 10 pg - 500 ng |
| Nuclease-free water | Up to 8 μL |
65℃孵育 5 min,迅速置于冰上并静置 2 min。
● RNA 模板变性处理有助于二级结构解链,可明显提高一链cDNA 的产量。对于长度超过3 kb 的cDNA 片段,此步骤不可省略 。
● 完整RNA 是合成长片段cDNA 的前提, 如无法保证RNA 完整度,建议增大RNA 投入量以增加完整RNA 的拷贝数,RNA 投入量最多可增加至5 μg。
2. 基因组 DNA 去除
| 组分 | 体积 |
| 上一步混合液 | 8 μL |
| 5 × gDNA Erase-Out Mix | 2 μL |
混匀,42℃反应 2 min
3. 一链 cDNA 合成反应体系
| 组分 | 体积 |
| 上一步混合液 | 10 μL |
| 4 × ToloScript RT EasyMix | 5 μL |
| Oligo (dT)20VN b | 1 μL |
| Nuclease-free water | 4 μL |
b. 也可使用GSP (2 pmol) 或Random hexamers。
4. 一链 cDNA 合成反应程序
| 温度 | 时间 |
| 50℃ | 5 min c |
| 85℃ | 2 min |
c. 如需获得更多cDNA 产物,可将反应时间延长至30 min。
产物可立即用于后续实验,或置于-20℃保存;如需长期存放建议分装后-70℃保存。产物应避免反复冻融。
体系后续反应为 qPCR
1. 基因组 DNA 去除
| 组分 | 体积 |
| 5 × gDNA Erase-Out Mix | 2 μL |
| Total RNA | 10 pg - 1 μg |
| or Poly A+ RNA | 10 pg - 100 ng |
| Nuclease-free water | up to 10 μL |
混匀,42℃反应 2 min。
2. 一链 cDNA 合成反应体系
| 组分 | |
| 上一步混合液 | 10 μL |
| 4 × ToloScript RT EasyMix | 5 μL |
| Oligo (dT)20VN | 1 μL |
| Random hexamers | 1 μL |
| Nuclease-free water | 3 μL |
● 也可使用GSP(2 pmol)进行逆转录。
3. 一链 cDNA 合成反应程序
| 温度 | |
| 37℃ | 15 min d |
| 85℃ | 2 min |
d. 如果模板具有复杂二级结构或高GC 区域,可将反应温度升高至50℃。
产物可立即用于后续实验,或置于-20℃保存;如需长期存放建议分装后-70℃保存。产物应避免反复冻融。
No RT Control 反应(可选)
1. 反应体系
| 组分 | |
| 基因组去除后的混合液e | 10 μL |
| 4 × NO RT Control EasyMix | 5 μL |
| Nuclease-free water | 5 μL |
e. 若后续实验为PCR,该反应液特指PCR 实验 流程中第2 步结束后的产物;若后续实验为qPCR,该反应液特指qPCR 实验流程中第1 步结束后的产物 。
混匀后按照下列程序反转录。
2. 反应程序
| 温度 | 时间 |
| 37℃/50℃ | 15 min/5 min f |
| 85℃ | 2 min |
f. 根据应用场景选择对应的反转录温度和时间 。
产物可立即用于后续实验,或置于-20℃保存。
注意事项
1. 本产品仅作科研用途。
2. 为防止 RNase 污染,请保持实验区干净整洁,操作时需穿戴干净的手套、口罩,实验所用枪头、离心管等耗材均为 RNase-free。
3. 引物选择
后续实验为 PCR
a) 如果模板为真核生物来源,一般情况下首选 Oligo (dT)20VN,与真核生物 mRNA 的 3' Poly A 尾配对,可获得全长 cDNA。
b) 基因特异性引物(GSP)的特异性最高。但有些情况下,用于 PCR 反应的 GSP 无法有效引导第一链cDNA 合成,这时可改用 Oligo (dT)20VN。
c) Random hexamers 特异性最低,所有 RNA,包括 mRNA,rRNA,tRNA 均可以作为 Randomhexamers 的模板;当目标区域具有复杂二级结构或 GC 含量较高,或者模板为原核生物来源,使用 Oligo (dT)20VN 或 GSP 无法有效引导 cDNA 合成时,可使用 Random hexamers 作为引物。
后续实验为 qPCR
a) 将 Oligo (dT)20VN 与 Random hexamers 以说明书比例混合使用,可使 mRNA 的各个区域 cDNA 合成效率相同,有助于提高定量结果的真实性和重复性。
b) 可以不经过基因组去除步骤直接进行逆转录,空余体积用 Nuclease-free water 补足即可,产物可立即用于后续实验,或置于-20℃保存。
常见问题解答
参考文献
COA查询
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